MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 49107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016077	TCCA	2	8	205482	205489	25 %	25 %	0 %	50 %	352683597
4002	NC_016077	AAGAT	2	10	205498	205507	60 %	20 %	20 %	0 %	352683597
4003	NC_016077	CGG	2	6	205514	205519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683597
4004	NC_016077	CAG	2	6	205686	205691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683597
4005	NC_016077	CAT	2	6	205731	205736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683597
4006	NC_016077	GCT	2	6	205767	205772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683597
4007	NC_016077	CAG	2	6	205775	205780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683597
4008	NC_016077	CT	3	6	205819	205824	0 %	50 %	0 %	50 %	352683597
4009	NC_016077	TCG	2	6	205840	205845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683597
4010	NC_016077	CCG	2	6	205862	205867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683597
4011	NC_016077	GAAG	2	8	205953	205960	50 %	0 %	50 %	0 %	352683597
4012	NC_016077	TGA	2	6	205961	205966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683597
4013	NC_016077	AGA	2	6	206129	206134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683597
4014	NC_016077	CTC	2	6	206199	206204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683597
4015	NC_016077	CAA	2	6	206222	206227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683597
4016	NC_016077	ATCA	2	8	206362	206369	50 %	25 %	0 %	25 %	352683597
4017	NC_016077	GAT	2	6	206481	206486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683597
4018	NC_016077	GATG	2	8	206495	206502	25 %	25 %	50 %	0 %	352683597
4019	NC_016077	GGCTT	2	10	206581	206590	0 %	40 %	40 %	20 %	352683597
4020	NC_016077	GCG	2	6	206604	206609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683597
4021	NC_016077	A	6	6	206697	206702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016077	AGGA	2	8	206711	206718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016077	TTTTGG	2	12	206732	206743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016077	GGC	2	6	206833	206838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683598
4025	NC_016077	AAG	2	6	206927	206932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683598
4026	NC_016077	GTC	2	6	206961	206966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4027	NC_016077	ACGG	2	8	206987	206994	25 %	0 %	50 %	25 %	352683598
4028	NC_016077	TTTC	2	8	207007	207014	0 %	75 %	0 %	25 %	352683598
4029	NC_016077	GCA	2	6	207097	207102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4030	NC_016077	AGCG	2	8	207112	207119	25 %	0 %	50 %	25 %	352683598
4031	NC_016077	TGA	2	6	207169	207174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683598
4032	NC_016077	TGC	2	6	207241	207246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4033	NC_016077	GCA	2	6	207276	207281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4034	NC_016077	GGCA	2	8	207355	207362	25 %	0 %	50 %	25 %	352683598
4035	NC_016077	TCT	2	6	207427	207432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683598
4036	NC_016077	GTC	2	6	207484	207489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4037	NC_016077	TGC	2	6	207498	207503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4038	NC_016077	GCA	2	6	207539	207544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683598
4039	NC_016077	TGA	3	9	207546	207554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683598
4040	NC_016077	GCAG	2	8	207559	207566	25 %	0 %	50 %	25 %	352683598
4041	NC_016077	AC	3	6	207589	207594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_016077	AGA	2	6	207646	207651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016077	A	7	7	207679	207685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016077	GCG	2	6	207780	207785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683599
4045	NC_016077	GGCT	2	8	207821	207828	0 %	25 %	50 %	25 %	352683599
4046	NC_016077	TCCCT	2	10	207829	207838	0 %	40 %	0 %	60 %	352683599
4047	NC_016077	GCC	2	6	207909	207914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683600
4048	NC_016077	AC	3	6	207944	207949	50 %	0 %	0 %	50 %	352683600
4049	NC_016077	AGG	2	6	207973	207978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683600
4050	NC_016077	CGC	2	6	207985	207990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683600
4051	NC_016077	TGA	2	6	208010	208015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683600
4052	NC_016077	TCG	2	6	208190	208195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683600
4053	NC_016077	TCT	2	6	208363	208368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683600
4054	NC_016077	TGC	2	6	208369	208374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683600
4055	NC_016077	GCT	2	6	208400	208405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683600
4056	NC_016077	CGT	2	6	208506	208511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683600
4057	NC_016077	CGG	2	6	208571	208576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683600
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4059	NC_016077	AGG	2	6	208879	208884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683600
4060	NC_016077	CTG	2	6	208925	208930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683600
4061	NC_016077	GCC	2	6	208966	208971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683600
4062	NC_016077	AGT	2	6	209063	209068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683600
4063	NC_016077	TAA	2	6	209096	209101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683600
4064	NC_016077	CAT	2	6	209144	209149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683600
4065	NC_016077	GGC	2	6	209151	209156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683600
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4070	NC_016077	A	6	6	209364	209369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_016077	A	6	6	210346	210351	100 %	0 %	0 %	0 %	352683602
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4094	NC_016077	CCTT	2	8	210682	210689	0 %	50 %	0 %	50 %	352683603
4095	NC_016077	TGA	2	6	210714	210719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683603
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4103	NC_016077	CGC	2	6	211240	211245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683604
4104	NC_016077	TTG	2	6	211246	211251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683604
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4108	NC_016077	GCC	2	6	211400	211405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683604
4109	NC_016077	GGA	2	6	211414	211419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683604
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4113	NC_016077	GGTGAG	2	12	211535	211546	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	352683604
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4115	NC_016077	TGA	2	6	211609	211614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683604
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4118	NC_016077	TCA	2	6	211770	211775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683604
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4120	NC_016077	GTT	2	6	211842	211847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683604
4121	NC_016077	CAT	2	6	211868	211873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683604
4122	NC_016077	ATG	2	6	211889	211894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683604
4123	NC_016077	A	6	6	211916	211921	100 %	0 %	0 %	0 %	352683604
4124	NC_016077	GAA	2	6	211930	211935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683604
4125	NC_016077	GCT	2	6	211940	211945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683604
4126	NC_016077	ATC	2	6	211953	211958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683604
4127	NC_016077	TCA	2	6	211969	211974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683604
4128	NC_016077	CTG	2	6	212009	212014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683605
4129	NC_016077	CTT	2	6	212017	212022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683605
4130	NC_016077	GGCA	2	8	212044	212051	25 %	0 %	50 %	25 %	352683605
4131	NC_016077	TGC	2	6	212188	212193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683605
4132	NC_016077	CGC	2	6	212269	212274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683605
4133	NC_016077	AGTC	2	8	212275	212282	25 %	25 %	25 %	25 %	352683605
4134	NC_016077	GTT	2	6	212306	212311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683605
4135	NC_016077	TCA	2	6	212341	212346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683605
4136	NC_016077	AGGCAC	2	12	212374	212385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683605
4137	NC_016077	AGC	2	6	212485	212490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683605
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4141	NC_016077	CTT	3	9	212710	212718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683605
4142	NC_016077	CGA	2	6	212725	212730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683605
4143	NC_016077	GCA	2	6	212745	212750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683605
4144	NC_016077	CAGC	2	8	212751	212758	25 %	0 %	25 %	50 %	352683605
4145	NC_016077	AGCCGC	2	12	212761	212772	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	352683605
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4148	NC_016077	CGC	2	6	212872	212877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683605
4149	NC_016077	ATA	2	6	212892	212897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683605
4150	NC_016077	CAG	2	6	212899	212904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683605
4151	NC_016077	CAT	2	6	212950	212955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683606
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4155	NC_016077	GGGC	2	8	213210	213217	0 %	0 %	75 %	25 %	352683606
4156	NC_016077	GGT	2	6	213321	213326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352683606
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4159	NC_016077	GAT	2	6	213451	213456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683606
4160	NC_016077	AGT	2	6	213533	213538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683607
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4168	NC_016077	TTG	2	6	214016	214021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683607
4169	NC_016077	AGGG	2	8	214024	214031	25 %	0 %	75 %	0 %	352683607
4170	NC_016077	TTC	2	6	214128	214133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683608
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4179	NC_016077	TGA	2	6	214633	214638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683608
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4187	NC_016077	CAGT	2	8	214865	214872	25 %	25 %	25 %	25 %	352683609
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4206	NC_016077	ACA	2	6	215504	215509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683609
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4211	NC_016077	GAG	2	6	215636	215641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_016077	ATT	2	6	215708	215713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352683610
4213	NC_016077	TGA	2	6	215759	215764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683610
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4222	NC_016077	GGCA	2	8	216294	216301	25 %	0 %	50 %	25 %	352683610
4223	NC_016077	TTCGG	2	10	216397	216406	0 %	40 %	40 %	20 %	352683610
4224	NC_016077	TGT	2	6	216446	216451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683610
4225	NC_016077	GAT	2	6	216462	216467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683610
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4228	NC_016077	ATG	2	6	216538	216543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683610
4229	NC_016077	CTTC	2	8	216614	216621	0 %	50 %	0 %	50 %	352683610
4230	NC_016077	TCG	2	6	216721	216726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683610
4231	NC_016077	TGA	2	6	216773	216778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683610
4232	NC_016077	GCCT	2	8	216876	216883	0 %	25 %	25 %	50 %	352683610
4233	NC_016077	TGACC	2	10	216890	216899	20 %	20 %	20 %	40 %	352683610
4234	NC_016077	GAC	2	6	216924	216929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683610
4235	NC_016077	GA	3	6	216958	216963	50 %	0 %	50 %	0 %	352683610
4236	NC_016077	GTCA	2	8	217011	217018	25 %	25 %	25 %	25 %	352683610
4237	NC_016077	ACC	2	6	217044	217049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352683610
4238	NC_016077	CTT	2	6	217061	217066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4239	NC_016077	CAAAA	2	10	217109	217118	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4240	NC_016077	TA	3	6	217120	217125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_016077	AAG	2	6	217131	217136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_016077	AGG	2	6	217152	217157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_016077	A	6	6	217227	217232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_016077	TAA	2	6	217248	217253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_016077	TATT	2	8	217320	217327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_016077	TG	3	6	217339	217344	0 %	50 %	50 %	0 %	352683611
4247	NC_016077	TGA	2	6	217377	217382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683611
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4249	NC_016077	GCC	2	6	217543	217548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683611
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4252	NC_016077	CTG	2	6	217723	217728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683611
4253	NC_016077	GCA	2	6	217794	217799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683611
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4258	NC_016077	TA	3	6	217991	217996	50 %	50 %	0 %	0 %	352683611
4259	NC_016077	GAA	2	6	218023	218028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683611
4260	NC_016077	GCT	2	6	218040	218045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683611
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4264	NC_016077	AGCT	2	8	218323	218330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4265	NC_016077	AGA	2	6	218429	218434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683612
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4268	NC_016077	GCT	2	6	218632	218637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683612
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4270	NC_016077	TCG	2	6	218947	218952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683612
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4272	NC_016077	GAGG	2	8	219058	219065	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_016077	ACG	2	6	219083	219088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683613
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4281	NC_016077	TGA	2	6	219416	219421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683613
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4309	NC_016077	AGG	2	6	221081	221086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4310	NC_016077	A	6	6	221109	221114	100 %	0 %	0 %	0 %	352683614
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4312	NC_016077	A	6	6	221338	221343	100 %	0 %	0 %	0 %	352683614
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4346	NC_016077	A	7	7	222997	223003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4347	NC_016077	TCCT	2	8	223016	223023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4360	NC_016077	GC	3	6	223860	223865	0 %	0 %	50 %	50 %	352683616
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4366	NC_016077	ATC	2	6	224220	224225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683616
4367	NC_016077	CGG	2	6	224270	224275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683616
4368	NC_016077	CCA	2	6	224395	224400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352683616
4369	NC_016077	TGC	2	6	224440	224445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683616
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4371	NC_016077	AAAG	2	8	224498	224505	75 %	0 %	25 %	0 %	352683616
4372	NC_016077	TCA	2	6	224527	224532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683616
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4375	NC_016077	GGC	2	6	224625	224630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683616
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4385	NC_016077	GTG	2	6	225162	225167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_016077	GTA	2	6	225174	225179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_016077	GCA	2	6	225210	225215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4388	NC_016077	TCT	2	6	225217	225222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4389	NC_016077	GGA	2	6	225224	225229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_016077	T	6	6	225243	225248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_016077	TCT	2	6	225260	225265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4392	NC_016077	GAA	2	6	225278	225283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_016077	CGCTCA	2	12	225802	225813	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	352683617
4399	NC_016077	TCG	2	6	225817	225822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683617
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4402	NC_016077	TCAG	2	8	225880	225887	25 %	25 %	25 %	25 %	352683617
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4414	NC_016077	TG	3	6	226458	226463	0 %	50 %	50 %	0 %	352683618
4415	NC_016077	CATGAC	2	12	226464	226475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	352683618
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4419	NC_016077	GCCT	2	8	226636	226643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4420	NC_016077	AGG	2	6	226654	226659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4474	NC_016077	TA	3	6	229531	229536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4475	NC_016077	G	6	6	229548	229553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4489	NC_016077	GCG	2	6	229922	229927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683622
4490	NC_016077	A	7	7	229951	229957	100 %	0 %	0 %	0 %	352683622
4491	NC_016077	AAT	2	6	229973	229978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683622
4492	NC_016077	ATC	2	6	229985	229990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683622
4493	NC_016077	TCA	3	9	229995	230003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683622
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4497	NC_016077	TAAAAA	2	12	230112	230123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4499	NC_016077	GCA	2	6	230193	230198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_016077	TGCC	2	8	230230	230237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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